Le CPC effectue des travaux de recherche dans différents domaines, en particulier sur le VIH/SIDA, les hépatites virales, les infections respiratoires, la tuberculose, et le paludisme. Il collabore avec de nombreuses institutions nationales et internationales. Les nombre de ses publications (notamment dans de prestigieuses revues scientifiques), et de ses communications orales dans des congrès internationaux attestent de la qualité de ses travaux.